Les joueurs s'affrontent en deux équipes dans Décrypto, chacune essayant d'interpréter correctement les messages codés qui lui sont présentés par ses coéquipiers tout en craquant les codes qu'elle intercepte de l'équipe adverse.
Plus en détail, chaque équipe a son propre écran, et dans cet écran, elle range quatre cartes dans des poches numérotées de 1 à 4, permettant à tous les membres de la même équipe de voir les mots de ces cartes tout en cachant les mots de l'équipe adverse. Au premier tour, chaque équipe fait ce qui suit : Un membre de l'équipe prend une carte codée qui montre trois des chiffres 1-4 dans un certain ordre, par exemple, 4-2-1. Il donne ensuite un message codé que ses coéquipiers doivent utiliser pour deviner ce code. Par exemple, si les quatre mots de l'équipe sont "cochon", "bonbon", "tente" et "fils", je pourrais dire "Sam-striped-pink" et espérer que mes coéquipiers parviennent à associer correctement ces mots à 4-2-1. S'ils devinent correctement, tant mieux ; sinon, nous recevons une marque noire d'échec.
À partir du deuxième tour, un membre de chaque équipe doit à nouveau donner un indice sur ses mots pour qu'ils correspondent à un code numéroté. Si j'obtiens 2-4-3, je pourrais maintenant dire "sucker-prince-stake". L'autre équipe essaie ensuite de deviner notre code numéroté. S'ils ont raison, ils reçoivent une marque blanche de réussite ; sinon, mon équipe doit deviner le numéro correctement ou prendre une marque noire d'échec. (Deviner correctement ne fait rien d'autre qu'éviter l'échec et donner à l'équipe adverse des informations sur ce que pourraient être nos mots cachés).
Les manches se poursuivent jusqu'à ce qu'une équipe récupère soit sa deuxième marque blanche (gagnant la partie), soit sa deuxième marque noire (perdant la partie). Les parties durent généralement entre 4 et 7 rounds. Si aucune équipe n'a gagné après huit tours, chaque équipe doit alors tenter de deviner les mots de l'autre équipe ; l'équipe qui devine le plus de mots correctement gagne.