Au fond de l'océan, personne ne t'entendra crier ! Sous la surface calme de l'océan, une guerre silencieuse se déroule entre deux sous-marins modernes.
Le jeu Captain Sonar se déroule en l'an 2048. Avec votre équipage, vous contrôlez l'un des deux nouveaux navires. Chacun de vous a une tâche spécifique. Vous devrez travailler en équipe, car un capitaine est impuissant sans son timonier, son ingénieur ou son navigateur. Quelle équipe sera victorieuse ?